Plodnosť muža je podmienená normálnym vývojom mužských pohlavných orgánov a normálnou spermiogenézou, teda tvorbou a dozrievaním spermií. Geneticky podmienená príčina neplodnosti tomuto prirodzenému procesu bráni. Z vrodených príčin sa na neplodnosti môžu podieľať aj nezostúpenie semenníkov do mieška alebo vrodené chyby mužských pohlavných orgánov.
Nepriechodnosť semenovodných kanálikov spôsobuje, že napriek zachovanej tvorbe spermií sa nedostávajú do ejakulátu, podobne ako vajíčko pri poškodených vajíčkovodoch u ženy. K nepriechodnosti semenovodov prichádza po zápaloch, operáciách, úrazoch alebo sterilizácii.
Porucha spermiogenézy môže mať aj hormonálnu príčinu, spočívajúcu v nedostatočnej produkcii mužských pohlavných orgánov. Neplodnosť u mužov môže byť spôsobená aj infekciou pohlavných orgánov alebo imunologickou príčinou. Pri neplodnosti spôsobenej imunologickou príčinou vytvára imunitný systém proti spermiám protilátky. V súčasnosti je najzávažnejším dôvodom mužskej neplodnosti redukcia počtu spermií alebo ich znížená funkčná schopnosť, čo sa pripisuje aj škodlivým vplyvom životného prostredia a nezdravému životnému štýlu.
Výrazný vplyv na kvalitu spermií má konzumácia alkoholu a fajčenie. Alkohol znižuje hladinu mužského pohlavného hormónu, objem semena a jeho hustotu. Fajčenie vplýva na pohyblivosť spermií. Medzi najdôležitejšie parametre určujúce oplodňovaciu kapacitu spermií patria koncentrácia spermií v ejakuláte, počet pohyblivých spermií, kvalita ich pohybu a tvar. Ejakulát musí obsahovať dostatočné množstvo spermií, ktoré sú dobrou pohyblivosťou schopné prejsť cez hlien krčka maternice na miesto spojenia spermie s vajíčkom, do vajcovodu.
Tvorbu a kvalitu spermií ovplyvňuje množstvo rôznych faktorov, zistenie presnej príčiny zníženej spermiogenézy však nie je možné. Neplodnosť u mužov podmieňujú aj iné ochorenia, napríklad porucha štítnej žľazy, cukrovka, alkoholizmus, ochorenie pečene. Isté percento neplodnosti mužov má nevysvetliteľnú príčinu.